Na seleção, defende a Bahamas. Atua principalmente como Defensor.

Última movimentação: do Dynamos FC BFA para o AC Raleigh em 2023-05-01.

Na Eliminatórias da Copa do Mundo FIFA (CONCACAF) 2026, Jonathan miller jogou 4 jogos, com média de 2.5 desarmes, 2.3 interceptações e 4 limpadas por jogo, além de 0 chutes bloqueados.