Atualmente joga pelo Rubio Ñu, com a camisa número 9. Atua principalmente como Avançado.

Na Primeira Divisão Paraguaia 2026, Pedro Federico Báez Benítez marcou 1 golos e deu 0 assistências em 5 jogos, média de 0.2 gol por jogo, 8 remates e 4 no gol.