Atualmente joga pelo Viktoria Plzeň Feminino, com a camisa número 29. Na seleção, defende a República Checa Feminino Sub-17. Atua principalmente como Guarda-redes.

Na Liga feminina Cambrinus checa 2025-2026, Natalie zizkova jogou 12 jogos, média de 0 interceptações, 0 desarmes e 0 limpesas por jogo.