Atualmente joga pelo Deportivo Cali Femininas, com a camisa número 44. Atua principalmente como Defesa.

Na Liga BetPlay Feminina da Colômbia 2025, Natalia Ruíz Zapata jogou 2 jogos, média de 0 desarmes, 0 interceptações e 0 limpesas por jogo, além de 0 remates bloqueados.