Atualmente joga pelo PAOK Salónica Femininas, com a camisa número 5. Atua principalmente como Defesa.

Na Qualificação para o Campeonato do Mundo Feminino FIFA (UEFA) 2026, Maria Gkouni Papaioannou jogou 1 jogos, média de 0 desarmes, 0 interceptações e 0 limpesas por jogo, além de 0 remates bloqueados.