Na seleção, defende a Sudão do Sul. Atua principalmente como Defesa.

Na Qualificação para o Campeonato do Mundo FIFA (CAF) 2026, Athir Thomas Magor Abdo Gaber jogou 6 jogos, média de 0 desarmes, 0 interceptações e 0 limpesas por jogo, além de 0 remates bloqueados.