Na seleção, defende a Guiné. Atua principalmente como Defensor.

Na Campeonato Africano das Nações da CAF 2024-2025, Mohamed Diabate jogou 4 jogos, com média de 1.3 desarmes, 1.3 interceptações e 2.8 limpadas por jogo, além de 0.3 chutes bloqueados.