Atualmente joga pelo PAOK Salônica Feminino, com a camisa número 5. Atua principalmente como Defensor.

Na Eliminatórias da Copa do Mundo Feminina da FIFA (UEFA) 2026, Maria Gkouni Papaioannou jogou 1 jogos, com média de 0 desarmes, 0 interceptações e 0 limpadas por jogo, além de 0 chutes bloqueados.