Saat ini ia bermain untuk FK Bylis Ballsh U19, mengenakan kaus bernomor 15. Ia bermain terutama sebagai Penyerang.

Perpindahan terakhirnya adalah dari FK Dinamo Tiranë U19 ke pada 2025-06-30.

Pada musim Liga Pemuda UEFA 2024-2025, Eldinjo Alimerkaj mencetak 0 gol dan memberikan 0 assist dalam 1 penampilan, dengan rata-rata 0 gol per pertandingan dari 0 percobaan tembakan dan 0 tepat sasaran.