Saat ini ia bermain untuk Istra 1961, mengenakan kaus bernomor 13. Ia bermain terutama sebagai Bek. Nilai pasar saat ini diperkirakan sebesar 250K €.

Perpindahan terakhirnya adalah Pinjaman dari NK Dubrava ke Dinamo Zagreb pada 2026-06-30.

Sepanjang Liga Sepak Bola Kroasia 2025-2026, Niko Šepić tampil dalam 7 pertandingan, dengan rata-rata 1 tekel, 0.4 intersepsi, dan 1.3 sapuan per pertandingan, serta memblokir 0 tembakan per pertandingan.