Di tingkat internasional, ia mewakili Bolivia U17. Ia bermain terutama sebagai Bek.

Sepanjang Piala Dunia U17 2025, Lysander Urena tampil dalam 3 pertandingan, dengan rata-rata 0 tekel, 0 intersepsi, dan 0 sapuan per pertandingan, serta memblokir 0 tembakan per pertandingan.