Saat ini ia bermain untuk FK Kolin, mengenakan kaus bernomor 18. Ia bermain terutama sebagai Bek.

Perpindahan terakhirnya adalah dari Mlada Boleslav U19 ke FK Kolin pada 2026-02-24.

Sepanjang Liga Ketiga Ceko 2025-2026, Jan Kubanek tampil dalam 1 pertandingan, dengan rata-rata 0 tekel, 0 intersepsi, dan 0 sapuan per pertandingan, serta memblokir 0 tembakan per pertandingan.