Saat ini ia bermain untuk Deportivo Saprissa, mengenakan kaus bernomor 13. Ia bermain terutama sebagai Penjaga gawang.

Perpindahan terakhirnya adalah dari Deportivo Saprissa II ke Deportivo Saprissa pada 2024-12-31.

Di Divisi Primera Kosta Rika 2025-2026, Isaac Alfaro bermain dalam 23 pertandingan, dengan rata-rata 0 intersepsi, 0 tekel, dan 0 sapuan per pertandingan.