Di tingkat internasional, ia mewakili Honduras U17. Ia bermain terutama sebagai Bek.

Sepanjang Piala Dunia U17 2025, Enmanuel Edgardo Martín Fugon tampil dalam 1 pertandingan, dengan rata-rata 5 tekel, 2 intersepsi, dan 3 sapuan per pertandingan, serta memblokir 0 tembakan per pertandingan.