Actualmente juega para el Marquense, con el dorsal 80. Juega principalmente en la posición de Centrocampista.

En 27 presencias en la temporada 2025-2026 de la Liga Nacional de Guatemala, william amaya registró 3 goles y 0 asistencias, además de completar 0 pases clave de un total de 0 pases con una precisión de pases de -.