Actualmente juega para el Mujeres de Baník Ostrava, con el dorsal 13. Juega principalmente en la posición de Centrocampista.

En 11 presencias en la temporada 2025-2026 de la Liga femenina Cambrinus checa, nikola pajunkova registró 0 goles y 0 asistencias, además de completar 0 pases clave de un total de 0 pases con una precisión de pases de -.