Actualmente juega para el Atlético Choloma, con el dorsal 3. Juega principalmente en la posición de Defensor. Su valor de mercado actual se estima en 25K €.

Su último movimiento fue un del CD Vida al CD Choloma el 2024-08-09.

Durante la temporada 2025-2026 de la Primera División de Honduras, milton nunez participó en 11 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.