A nivel internacional, representa a la Colombia Sub-17 Femenina. Juega principalmente en la posición de Centrocampista.

En 1 presencias en la temporada 2025 de la Sudamericano Femenino Sub-17 de la CONMEBOL, Vanessa Leonor Puerta registró 0 goles y 1 asistencias, además de completar 0 pases clave de un total de 11 pases con una precisión de pases de 3.