Actualmente juega para el CD Mensajero, con el dorsal 17. Juega principalmente en la posición de Defensor. Mide 185 cm y pesa 72 kg.

Durante la temporada 2025-2026 de la Tercera División RFEF, Pedro Juan Morillo Aguilar participó en 21 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.