Actualmente juega para el Deportivo Cali Femenino, con el dorsal 44. Juega principalmente en la posición de Defensor.

Durante la temporada 2025 de la Liga BetPlay Femenina de Colombia, Natalia Ruíz Zapata participó en 2 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.