Actualmente juega para el JK Welco Elekter, con el dorsal 24. Juega principalmente en la posición de Defensor. Su valor de mercado actual se estima en 25K .

Su último movimiento fue un Préstamo del JK Welco Elekter al Tartu JK Maag Tammeka el 2026-12-31.

Durante la temporada 2025 de la Esiliiga de Estonia, Mihkel Sepp participó en 17 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.