Actualmente juega para el JK Welco Elekter, con el dorsal 24. Juega principalmente en la posición de Defensor. Su pie preferido es el Derecho. Su valor de mercado actual se estima en 25K €.

Su último movimiento fue un Préstamo del JK Welco Elekter al Tartu JK Maag Tammeka el 2026-12-30.

Durante la temporada 2025 de la Esiliiga de Estonia, Mihkel Sepp participó en 17 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.