A nivel internacional, representa a la Luxemburgo Sub-21. Juega principalmente en la posición de Defensor.

Durante la temporada 2025-2026 de la Copa de Alemania, Miguel Fernandes Goncalves participó en 1 partidos, con un promedio de 4 entradas, 1 intercepciones y 2 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.