Actualmente juega para el Barakaldo CF, con el dorsal 26. Juega principalmente en la posición de Centrocampista. Su valor de mercado actual se estima en 100K .

Su último movimiento fue un del Deportivo Alavés C al Barakaldo CF el 2026-07-01.

En 2 presencias en la temporada 2025-2026 de la Copa del Rey, Markel Ruiz Pérez registró 0 goles y 0 asistencias, además de completar 3 pases clave de un total de 20 pases con una precisión de pases de 7.5.