Actualmente juega para el PAOK Salónica Femenino, con el dorsal 5. Juega principalmente en la posición de Defensor.

Durante la temporada 2026 de la Clasificación para la Copa Mundial Femenina de la FIFA (UEFA), Maria Gkouni Papaioannou participó en 1 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.