Actualmente juega para el Atalanta Sub-20, con el dorsal 3. Juega principalmente en la posición de Defensor.

Durante la temporada 2025-2026 de la Campionato Primavera 1 italiano, Manuel Maffesoli participó en 20 partidos, con un promedio de 0.1 entradas, 0.1 intercepciones y 0.5 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.