A nivel internacional, representa a la Pakistán. Juega principalmente en la posición de Defensor. Su pie preferido es el Izquierdo. Su valor de mercado actual se estima en 50K €.

Durante la temporada 2027 de la Copa Asiática de la AFC, Junaid Shah participó en 3 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.