Actualmente juega para el Independiente Santa Fe (F), con el dorsal 8. A nivel internacional, representa a la Colombia Femenina. Juega principalmente en la posición de Centrocampista.

En 2 presencias en la temporada 2024 de la Liga BetPlay Femenina de Colombia, Juana Sofía Ortegón Giraldo registró 0 goles y 0 asistencias, además de completar 0 pases clave de un total de 0 pases con una precisión de pases de -.