Actualmente juega para el Almagro, con el dorsal 17. Juega principalmente en la posición de Centrocampista. Su valor de mercado actual se estima en 75K .

Su último movimiento fue un Préstamo del Almagro al Ferrol Carril Oeste el 2026-12-31.

En 2 presencias en la temporada 2026 de la Primera Nacional de Argentina, Juan Martín Fernández Pinto registró 0 goles y 0 asistencias, además de completar 0 pases clave de un total de 0 pases con una precisión de pases de -.