Actualmente juega para el CSD Antofagasta, con el dorsal 25. Juega principalmente en la posición de Portero. Su valor de mercado actual se estima en 50K .

Su último movimiento fue un del Antofagasta U19 al CSD Antofagasta el 2020-01-01.

En la temporada 2026 de la Liga de Ascenso de Chile, Juan cisternas jugó 2 partidos, con un promedio de 0 intercepciones, 0 entradas y 0 despejes por partido.