Actualmente juega para el Real Jaén CF, con el dorsal 16. Juega principalmente en la posición de Centrocampista.

En 24 presencias en la temporada 2025-2026 de la Segunda División RFEF española, Juan Manuel Segura Zamora registró 1 goles y 0 asistencias, además de completar 0 pases clave de un total de 0 pases con una precisión de pases de -.