Juega principalmente en la posición de Defensor. Mide 170 cm y pesa 68 kg. Su pie preferido es el Izquierdo.

Durante la temporada 2025 de la Copa Centroamericana de la CONCACAF, Juan Alfredo Barahona Peña participó en 4 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.