A nivel internacional, representa a la Bahamas. Juega principalmente en la posición de Defensor.

Su último movimiento fue un del Dynamos FC BFA al AC Raleigh el 2023-05-01.

Durante la temporada 2026 de la Clasificación para la Copa Mundial de la FIFA (CONCACAF), Jonathan miller participó en 4 partidos, con un promedio de 2.5 entradas, 2.3 intercepciones y 4 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.