Juega principalmente en la posición de Defensor. Su pie preferido es el Izquierdo.

Durante la temporada 2024 de la Copa Argentina, Jonathan Ezequiel Medina participó en 2 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0.5 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.