Actualmente juega para el FC Kuressaare, con el dorsal 68. Juega principalmente en la posición de Defensor. Su valor de mercado actual se estima en 50K €.

Su último movimiento fue un Fichaje Libre del Flora Tallinn II al FC Kuressaare el 2026-03-02.

Durante la temporada 2025 de la Premium Liiga de Estonia, Johann Vahermägi participó en 6 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.