Actualmente juega para el FK Kolín, con el dorsal 3. Juega principalmente en la posición de Defensor.

Su último movimiento fue un del Mlada Boleslav U19 al FK Kolin el 2026-02-25.

Durante la temporada 2025-2026 de la Tercera Liga checa, Jan Kubanek participó en 1 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.