Actualmente juega para el Real Santa Cruz, con el dorsal 39. Juega principalmente en la posición de Centrocampista.

Su último movimiento fue un del Royal Pari Fútbol Club II al Real Santa Cruz el 2023-03-29.

En 27 presencias en la temporada 2024 de la Primera División de Bolivia, Gerson Malgor registró 0 goles y 0 asistencias, además de completar 0 pases clave de un total de 0 pases con una precisión de pases de -.