Actualmente juega para el Lorca Deportiva FC, con el dorsal 15. Juega principalmente en la posición de Defensor. Mide 192 cm y pesa 80 kg.

Durante la temporada 2025-2026 de la Tercera División RFEF, Francisco José Navarro Zapata participó en 8 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.