Actualmente juega para el Sportivo Luqueño, con el dorsal 21. Juega principalmente en la posición de Centrocampista.

En 5 presencias en la temporada 2026 de la Primera División Paraguaya, Fernando René Bobadilla Sánchez registró 0 goles y 0 asistencias, además de completar 1 pases clave de un total de 17 pases con una precisión de pases de 2.8.