Actualmente juega para el Juan Pablo II, con el dorsal 26. Juega principalmente en la posición de Defensor. Su pie preferido es el Derecho. Su valor de mercado actual se estima en 250K €.

Su último movimiento fue un del Juventud La Joya al Juan Pablo II el 2024-02-20.

Durante la temporada 2026 de la Liga 1 de Perú, Fabio Agurto participó en 3 partidos, con un promedio de 0.7 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.