Actualmente juega para el FC Ordino, con el dorsal 9. Juega principalmente en la posición de Delantero. Su valor de mercado actual se estima en 200K €.

Su último movimiento fue un del FC Ordino al FC Rànger's el 2026-02-01.

En la temporada 2025-2026 de la Primera División de Andorra, Borja Morales marcó 3 goles y dio 0 asistencias en 12 presencias, con un promedio de 0.3 goles por partido, 0 tiros intentados y 0 tiros al palmarés.