A nivel internacional, representa a la Esuatini. Juega principalmente en la posición de Defensor.

Su último movimiento fue un del al Mbabane Swallows el 2024-08-14.

Durante la temporada 2026 de la Clasificación para la Copa Mundial de la FIFA (CAF), Bongi Magagula participó en 4 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.