يلعب حاليًا لصالح فونيكس لوبيك، ويرتدي القميص رقم 10. يلعب بشكل أساسي في مركز مهاجم. تُقدّر قيمته السوقية الحالية بـ 125K €.

كانت آخر انتقالاته من SV Eichede إلى Phonix Lubeck في 2022-06-30.

في موسم الدوري الإقليمي الألماني 2025-2026، سجّل Jonathan Stöver 2 أهداف وقدّم 0 تمريرات حاسمة في 3 مباراة، بمعدل 0.7 أهداف لكل مباراة من 0 تسديدة منها 0 على المرمى.